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GeneXpress 06

Regulative RNAs

QuestionAnswer
wie können einige RNA-Moleküle ihre eigene Translationregulieren? Über Riboswitch
Riboswitch? wo? eine mRNA Domäne, daran binden Liganden,und so die Translation reguliert, indem sie jeweils von 2 möglichen eine Struktur annimmt, kann Ribozym sein.bis jetzt nur be Prok
Riboswitch Adenin wenn viel Adenin, lagert sich in RNA-Struktur, Transkription wird gehemmt. Wenn aber wenig ehe offene Struktur-> Transkiption startet
haben Bakt regulatorische RNA? welche? ja sRNA short RNA, viele Regulationen,
Welche Regulative Funktionen haben kleine RNAS? 1.Gene Silencing 2.RNAi 3.Imprinting ncRNAs 4.Methylierungen 5.Histonmodifikation 6.Initiation der Translation inhibiert 7.Termination der Transkription 8.Ziel für Endonucleasen 9.Strukturänderung der RNA-> Loops verhinderung
Regulative mRNA Bsp bei Euk Viren, über Struktur, IRES Elemente in RNA, damit können mehrere Startcodons gemacht werden,können an Ribosom binden(wie Cap)
wie kann IRES in Molbio verwendet werden? wenn 2 Gene gleichzeitig exprimiert werden sollen, IRES in der Mitte, Bindet an Ribosom, erst wird ein dann andere Gen Exprimiert z.b Antikörper, leiche und schwere Kette. muss aber in der selben Zelle geschehen
gibt es Polycistronische RNA bei Euk? ja aber bei Viren, mit IRES und nicht viral: IRE Iron Responsive element auch mit Poly Cistronische RNA mit reg RNA
RNAi durch dsRNA ausgelöste Reaktion, die zum Abbau der mRNA oder Abbau von dsRNA homologe RNA führt
siRNA 21nt: sind immer ds,19 nt und je 2 3' Überhang, Komplette Paarung wichtig,sind Femdcdiert,
RNAi Ablauf? ds Rna injiziert der viral von Außen-> DICER zerlegt diese in kleinen 21bp siRNA Stücken-> Diese werden an RISC weitergegeben-> ds wird in ss zerlegt-> wenn passende mRNA zu si-ssRNA perfekt bindet-> werd alles abgebaut(Ago2)
wie wird durch miRNA reguliert?was? Translation wird reg, Ablauf wie siRNA, nur bei miRNA keine Perfekte Paarung, Hemmt nur die Translation, aber kein Abbau der mRNA
wie läuft RNAi bei Pflanzen, Funktion der RdRP? RNAi läuft wie gehabt,RdRP nutzt siRNA als Primer und produziert ds mRNA, werden auch von DICER geschnitten,in Pflanze weiter gegeben (ber Plasmodesmen), deswegen sind bei Pfrupfung auch in anderen Pflanze die Virenpartikel zu finden
Warum die Produktion von dsRNA durch RdRP? Abwehr, Virale ssRNA wird dsRNA gemacht-> DICER zerstört sie->Systemische Effekt
RNA vermittelte DNA Methylierung?RDM Chromatin Silencing durch siRNAs, dsRNA homolog zum Promoter-> Stillegung des Gens,
Reverse genetik? nicht von Phynotyp zu Genotyp, sondern von enotyp zu Phynotyp:mir siRNA gene Ausschalten oder verändern
miRNA Synthese? pri-miRNA im Kern (mit Cap und Poly A)->mit DROSHA (tier) prä-mRNA (70nt) Hairpin-> wird in Cytoplasma transprotiert-> DICER macht miRNA und loop von Hairpin wird abgespalten
woraus können miRNA entstehen? 1. Introns proteincodierender mRNAs 2. Intron Exon nicht-codierender mRNAs werden durch Pol II synthet.
welche gemeinsamtkeiten haben Bakt RNAS III, DROSHA und DICER? DRSHA und DCER gehören zu Familie der RNAS III,schneiden dsRNA, wobei 2nt 3'Überhang bleibt. haben homologe Teile wie Bakt RNAase III.
Pflanzen haben nur DICER kein DROSHA, Merkmale der miRNA bei Pflanzen? duch DICER im Kern Prozessiert,bleibt im Kern,hohe Spezifität, Ziel 5'UTR, spaltet auch mRNA
Tiere haben DICER (cyto)und DRSHA(Kern), Merkmale der miRNA? in 2 schritten mit DRSHA(kern) u DICER(cyt) prozessiert,im Kern und Cyto, geringer Spezifität,Ziel 3'UTR, hemmt Translation
Wo können miRNA regulierend eingreifen? 1.Inhibition der Elonation bei Translation 2.Proteolyse während der Translatin 3.Entfernen des 5' Cap von Translation 4.inhibition der Ribosomenbildung 5. ertfernung von PolyA
unterschied grob siRNA und miRNA? siRN A schutzt vor virale RNA miRNA kontrolle der Entwicklungsvorgänge auf mRNA basis (aber nicht in Keimhanen)
Created by: sh2013
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