Help
Options
Didn't know it?
click below
click below
Knew it?
click below
click below
Don't Know
Remaining cards (0)
Know
retry
shuffle
restart
0:00
Embed Code - If you would like this activity on your web page, copy the script below and paste it into your web page.
Normal Size Small Size show me how
Normal Size Small Size show me how
GENETYKA - ÄW3
Genetyka drożdży.
| Question | Answer |
|---|---|
| Jakie cechy drożdży czynią z nich odpowiedni organizm modelowy? | Krótki czas generacji, liczne potomstwo w krótkim czasie, materiał łatwo dostępny i tani, proste metody hodowli. Nie są zakaźne. Łatwa transformacja plazmidami i proste metody izolacji kwasów nukleinowych i białek. Łatwość indukcji mutacji. |
| Jak wygląda genom drożdżowy? | Mały genom zawiera 16 chromosomów, które przypominają strukturą i mechanizmami wyższe organizmy. 75% jego genomu zajmują geny, wysokie podobieństwo w składzie aminokwasowym do białek ludzkich. Mała liczba genów bez intronów, cały genom znany. |
| Jakie są dwie szczególne cechy drożdżowe? | Występują naturalnie zarówno w formie diploidalnej, jak i haploidalnej. Zachodzi w nich tzw. rekombinacja homologiczna. |
| Czym jest rekombinacja homologiczna? | Proces, który pozwala na zastąpienie prawidłowego genu jego uszkodzoną kopią (i na odwrót) wprowadzoną do komórki z zewnątrz (ukierunkowana inaktywacje genów). |
| Dlaczego badania funkcji danego białka poprzez ukierunkowaną inaktywację genów przeprowadza się na haploidach? | U haploidów skutek uszkodzenia genu nie jest maskowany przez jego drugą prawidłową kopię co ma normalnie miejsce w komórkach diploidalnych. |
| Co to znaczy, że drożdże sa fakultatywnymi tlenowcami? | Że mogą żyć bez funkcjonujących mitochondriów, przeprowadzając fermentację, gdy w środowisku dostępne jest fermentowalne źródło węgla (np. glukoza). |
| Jak oddziela się jądrowe i mitochondrialne mutanty związane z procesami oddychania wewnątrzkomórkowego? | Wykorzystuje się ich niezdolność do wzrostu na podłożch zawierających niefermentowalne źródło węgla, np. glicerol czy etanol. |
| Jakie badania prowadzono na drożdżach? | Projekt sekwencjonowania, badanie chorób genetycznych u ludzi np. zespół Wernera, progerie, badanie mechanizmów zmian nowotworowych, zaburzenia układu nerwowego i kostnego. |
| Czym charakteryzuje się genom jądrowy? | 14 chromosomów od 200 do 2200kpz. Informacja jest silnie skondensowana (72% koduje, 3,8% zawiera introny). rRNA kodowane są tandemowo i występują w 120 kopiach zlokalizowanych na chromosomie XII. Chromosomy zawierają retrotranspozony. Zawiera plazmid. |
| Czym są retrotranspozony? | Transpozony RNA, zawierają geny kodujące enzymy niezbędne do przemieszczania się w procesie transpozycji. |
| Czym charakteryzuje się plazmid jądrowy? | Ma wielkość dwóch mikronów, występuje w ok. 100 kopiach, zawiera informację stanowiącą około 5% informacji genetycznej drożdży, funkcja jest nieznana, dziedziczą się niezgodnie z prawami Mendla. |
| Co oznacza zapis URA3? | Gen typu dzikiego - oznacza zdolność do syntezy uracylu. |
| Co oznacza zapis ura3? | Allel recesywny - oznacza allel recesywny - brak zdolności do syntezy uracylu. |
| Co oznacza zapis ura3-Δ1? | Mutacja recesywna typu delecji. |
| Co oznacza zapis ura3::LEU2? | Mutacja przez insercję innego genu dzikiego. |
| Co oznacza zapis ura3Δ::LEU2? | Mutacja delecji przez zastąpienie genu URA3 innym genem typu dzikiego. |
| Co oznacza zapis Ura+? | Szczep nie potrzebuje do wzrostu uracylu? |
| Co oznacza zapis Ura-? | Szczep wymagający do wzrostu uracylu. |
| Co oznacza, że szczep jest prototroficzny względem uracylu? | Jest zdolny do syntezy uracylu, nie wymaga dodatku uracylu w pożywce - wykazuje wzrost na podłożu minimalnym bez uracylu. |
| Co oznacza, że szczep jest auksotroficzny względem uracylu? | Nie jest zdolny do syntezy uracylu, wymaga dodatku uracylu w pożywce, nie wykazuje wzrostu na podłożu minimalnym bez uracylu. |
| Co oznacza zapis YAR077w? | Otwarta ramka odczytu; Y - drożdże, A - chromosom I, R- prawe ramię chromosomu, 077 - numer porządkowy, w - nić watsona (c- gdy Cricka). |
| Czym charakteryzuje się genom mitochondrialny? | Stanowi 10% informacji genetycznej drożdże. mtDNA występuje w mitochondriach jako kolista, dwuniciowa cząsteczka DNA, ale może mieć też formę liniową. mtDNA bogate jest w pary AT. Zawiera ok 80 kpb. Geny szybko ewoluują, gdyż brak mechanizmów naprawy. |
| Jak zachowują się mutanty oddechowe na podłożu z glukozą? | Tworzą na takim podłożu mniejsze kolonie w porówaniu do szczepów oddychających. |
| Co to znaczy, że gen jest mozaikowy? | Tzn. że jest podzielony i składa się z intronów i eksonów. |
| Jake geny mozaikowe występują w genomie mitochondrialnym? | cytb, cox1, LSU. |
| Czym charakteryzują się introny mitochondrialne? | Są zdolne do samowycinania i przenoszenia się do miejsc homologicznych. Tzw. introny mobilne. |
| Jaki proces zachodzi u intronów mitochondrialnych typu I? | Intron homing - polega na nacięciu genu bezintronowego przez endonukleazę kodowaną przez intron, a uszkodzenie DNA jest naprawiane na matrycy genu z intronem, czego wynikiem jest wstawienie intronu w nowe miejsce. |
| Jaki proces zachodzi u intronów mitochondrialnych typu II? | Retrohoming - introny typu II mogą kodować białka o potrójek aktywności: maturazy, endonukleazy i odwrotnej transkryptazy, co umożliwia przeniesienie tego intronu w nowe miejsce poprzez odwrotną transkrypcję mRNA genu zawierającego intron. |
| Jakie występują rodzaje mutantów oddechowych? | Mitochondrialne (rho-, rho0, mit-, syn-, antR, mim), jądrowe (pet, jądrowe supresory defektów mitochondrialnych). |
| Czy komórka PET rho+ jest zdolna do oddychania? | Tak. |
| Czy komórka PET rho0 jest zdolna do oddychania? | Nie. |
| Czy komórka PET rho- jest zdolna do oddychania? | Nie. |
| Czy komórka PET mit- jest zdolna do oddychania? | Nie. |
| Czy komórka pet rho+ jest zdolna do oddychania? | Nie. |
| Czy komórka pet rho0 jest zdolna do oddychania? | Nie. |
| Czy komórka pet rho- jest zdolna do oddychania? | Nie. |
| Na czym polega mutacja rho-? | Delecja dużych fragmentów DNA mitochondrialnego (do 50% genomu). Wielkość DNA mitochondrialnego nie ulega zmianie dzięki reiteracji pozostającego fragmentu. |
| Jaki jest fenotyp mutacji rho-? | Niewydolność oddechowa, na podłożu z glukozą tworzą mniejsze kolonie, ponieważ niemożliwy jest szybki wzrost z powodu niedoboru energii uzyskanej tylko z fermentacji. W mitochondriach nie zachodzi oddychanie ani synteza białek mit. |
| Na czym polega mutacja rho0? | Całkowita utracja mtDNA. |
| Jaki jest fenotyp mutacji rho0? | Niewydolność oddechowa, na podłożu z glukozą tworzą mniejsze kolonie, ponieważ niemożliwy jest szybki wzrost z powodu niedoboru energii uzyskanej tylko z fermentacji. W mitochondriach nie zachodzi oddychanie ani synteza białek mit. |
| Na czym polega mutacja mit-? | Punktowe mutacje lub niewielkie delecje w mtDNA. |
| Jaki jest fenotyp mutacji mit-? | Utrata aktywności konkretnych genów, synteza pozostałych białek odbywa się bez przeszkód. |
| Na czym polega mutacja syn-? | Punktowe mutacje w mtDNA. Najczęściej dotyczą genów tRNA, niektóre w genach rRNA. |
| Jaki jest fenotyp mutacji syn-? | Zaburzenie syntezy białka w mitochondriach. |
| Na czym polega mutacja antR? | Punktowe mutacje w mtDNA. |
| Jaki jest fenotyp mutacji antR? | W komórkach pojawia się oporność na pewne antybiotyki hamujące funkcjonowanie mitochondriów. |
| Na czym polega mutacja mim? | Mutacje mitochondrialne będące supresorami defektów typu min-. |
| Na czym polega mutacja pet? | Jądrowe mutacje. Defekty dotyczą zarówno struktury i metabolizmu jak i ekspresji genów mitochondrialnych. |
| Jaki jest fenotyp mutacji pet? | Niewydolność oddechowa na skutek zaburzenia funkcjonowania mitochondriów. |
| Przykład podłoża, na którym nie są zdolne do wzrostu mutanty mitochondrialne? | N3 lub YPGlic. |
| Do czego służy podłoże minimalne? | Do selekcji mutantów auksotroficznych. Na podłożu minimalnym bez żadnych dodatków rosną tylko prototrofy. |
| Do czego służy podłoże pełne YPGlic? | Do selekcji mutantów oddechowych. |
| Do czego służy podłoże SPM? | Jest to podłoże sporulacyjne. |
| Rodzaje podłoży hodowlanych | pełne YPG (glukoza), minimalne G0, pełne YPGlic, SPM |
| Jak rozmnażają się drożdże? | Poprzez pączkowanie. Komórka potomna jest inicjowana jako pączek na komórce matczynej. Podczas jego wzrostu następuje kariokineza i cytokineza. |
| Na czym polega pączkowanie bipolarne? | Pączkowanie występujące u diploidów, gdzie kolejny pączek pojawia się na drugim biegunie komórki. |
| Na czym polega pączkowanie aksjalne? | Pączkowanie występujące u haploidów, gdzie kolejne pączki pojawiają się w pobliżu miejsca powstania poprzedniego pączka. |
| Jaki barwnik barwi chitynę obecną w miejscu połączenia pączka i komórki matczynej? | Calcofluor. |
| Jak zachowują się komórki diploidalne w warunkach głodu? | Dochodzi do mejozy i powstania 4 haploidalnych spor zamkniętych w worku. Spory ułożone są luźno i przypadkowo. W worku znajdują się 2 spory o typie płciowym a (MATa) i 2 spory o typie płciowym α (MATα). |
| Jak rozmnażają się komórki haploidalne? | Poprzez mitozę. |
| Czym jest koniugacja u drożdży? | Połączenie dwóch komórek o przeciwnym typach koniugacyjnych a z α i różnych genomach mitochondrialnych. Powstaje heteroplazmatyczna zygota. Powstaje diploid. |
| Jak brzmi pierwsza zasada dziedziczenia mitochondrialnego? | Segregacja mitotyczna w fazie diploidalnych. Po kilku lub kilkunastu mitotycznych podziałach komórek diploidalnych a/α następuje segregacja cech mit. i powstają homoplazmatyczne diploidy o genotypach mit rodzicielskich i/lub zrekombinowanych. |
| Jak brzmi druga zasada dziedziczenia mitochondrialnego? | Brak segregacji mejotycznej - genotyp mitochondrialny wszystkich spor jest taki sam jak wyjściowego diploida. |
| Jaki jest stosunek segregacji po koniugacji? | 2:2 |
| Na czym polega polarność? | Zjawisko typowe dla dziedziczenia pewnych cech mitochondrialnych. W przypadku polarnej transmisji zamiast normalnego rozdziału cech rodzicielskich (1:1) obserwuje się bardzo znaczną przewagę jednego z genotypów nad drugim. |
| Jakie feromony wydzielają komórki typu a, a jakie receptory posiadają? | feromony a, receptory dla feromonu α. |
| Jakie feromony wydzielają komórki typu α? | feromony α, receptory dla feromonu a. |
| Czym jest shmooing? | Przyjęcie kształtu stożkowatego przez komórki drożdży po rozpoczęciu krzyżowania. |
| Jak przebiega koniugacja? | Gdy komórki a i α znajdą się w pobliżu, przyłączenie feromonów aktywuje kaskady sygnalne, które prowadzą do zahamowania cyklu w fazie G1. Zachodzi shmooing i fuzja komórek - powstaje "hantla". Dochodzi do zlania cytoplazmy i fuzji jąder - powstaje zygota. |
| Które pokolenie jest dominujące w cyklu życiowym drożdży? | Diploidalne - po kiełkowaniu spor bardzo szybko dochodzi do koniugacji między komórkami a i α. |
| Na czym polega zmiana typu koniugacyjnego? | Niektóre komórki haploidalne są zdolne do zmiany typu koniugacyjnego na przeciwny, zwłaszcza wtedy, gdy występują tylko haploidy typu a lub α. |
| Czym są szczepy homotaliczne? | Szczep zdolny do zmiany typu koniugacyjnego. |
| Czym są szczepy heterotaliczne? | Niezdolne do zmiany typu koniugacyjnego. |
| Na czym polega kasetowy model zmiany typu koniugacyjnego? | Jeżeli gen warunkujący typ a lub α zostanie przecięty przez endonukleazę HO, powstałe uszkodzenie jest naprawiane w procesie konwersji genów, gdzie uszkodzenie DNA jest naprawiane na matrycy cichej kopii genu kodującego przeciwny typ koniugacyjny. |
| Czym są kasety u drożdży? | Komórka haploidalna posiada trzy kopie genów warunkujące typ koniugacyjny w trzech różnych locus na chromosomie III. Geny HMRa i HMRα są nieaktywne. Aktywny jest tylko locus MATα lub MATa. |
| Do czego służy test komplementacji? | Do określenia, czy dwie mutacje leżą w tym samym genie czy w dwóch różnych genach. Szczególnie użyteczny do testowania alleliczności mutacji o tym samym efekcie fenotypowym. |
| Czym jest mutacja alleliczna? | Leżąca w tym samym genie. |
| Czym jest mutacja niealleliczna? | Leżąca na dwóch różnych genach. Mogą leżeć w genach, których produkty białkowe biorą udział w różnych procesach metabolicznych lub w tym samym procesie. |
| Co ile dzielą się drożdże w korzystych warunkach a co ile w niekorzystnych? | W korzystnych co 90 minut, w niekorzystnych 140 minut. |
| Jaki jest cel testu komplementacji | W wyniku krzyżówki otrzymywane są szczepy diploidalne, u których w zależności od powstałego układu mutacji dochodzi do maskowania defektów wnoszonych przez zmutowane szczepy lub maskowanie defektu jest niemożliwe. |
| Co oznacza wynik dodatni testu komplementacji? | Powstanie heterozygoty w analizowanym locus. |
| Jakie mutacje można badać w teście komplementacji? | Tylko recesywne. |
| Co oznacza układ trans? | Dwie mutacje leżą na dwóch różnych chromosomach. |
| Co oznacza układ cis? | Dwie mutacje leżą na tym samym chromosomie. |
| Kiedy zachodzi komplementacja w układzie cis? | Zawsze. |
| Kiedy zachodzi komplementacja w układzie trans? | Tylko wtedy, gdy mutacje leżą na różnych genach. |
| O czym mówi regułą Benzera? | Jeśli dwie mutacje są niealleliczne to będą komplementowały niezależnie od pozycji w jakiej się znajdują. Natomiast mutacje alleliczne będą wykazywać efekt pozycji cis-trans i będą komplementowały się tylko w pozycji cis. |
| Czym jest cistron? | Odcinek DNA, który w teście wykazuje efekt pozycji. |
| Czym sa mutacje izoaleliczne? | Mutacja alleliczna, która dotyczy tej samej pozycji w genie. |
| Czym są mutacje heteroalleliczne? | Mutacje dotyczące różnych pozycji w genie. |
| Jak rozróżnić mutację heteroalleliczną od izoallelicznej? | Na podstawie dziedziczenia cech przez produkty mejozy - powstanie zrekombinowanej spory o dzikim fenotypie wskazuje na heteroalleliczność mutacji. |
| Jak wuykonuje się test komplementacji na organizmach diploidalnych? | Na homozygotach recesywnych. Krzyżówka dwóch mutantów diploidalnych posiadających ten sam fenotyp pozwala również na sprawdzenie, czy dwie analizowane w krzyżówce mutacje recesywne dotyczą tego samego genu i czy są położone w pozycji cis lub trans. |
| Jakie są możliwe interpretacje testu komplementacji na organizmach diploidalnych? | Jeżeli potomstwo krzyżówki osobników będącymi homozygotami recesywnymi daje potomstwo o cechach rodzicielskich - allele są wariantami tego samego genu. Natomiast jeśli potomstwo ma cechy nierodzicielskie - allele są wariantami różnych genów. |
| Co oznacza negatywny wynik test komplementacji? | Mutacje dotyczą tych samych genów, ale możliwe jest też że mutacja jednego z genów wpływa na ekspresję drugiego, wynikiem jednej mutacji jest powstanie produktu będącego inhibitorem, przynajmniej jedna z mutacji nie jest recesywna. |
Created by:
biotech4