Transkription Euk
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| Pol 1 | im Kern große rRNA
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| Pol II | im Kern pre-miRNA, miRNA,
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| Pol III | im Kern tRNA, 5S-RNA,
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| RdRP | RNA abhängie RNA Pol: in Cytoplasma,siRNA
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| welche Ähnlichkeit Haben alle Pol | als Grundgerust Core- Enzym, besteht aus mehreren UE
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| woraus besteht Core Promoter | BRE--TATA---INR---DPE
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| wo liegt TATA Box | -25-35 upstream vom Start
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| Aufbau TATA Box | Konsensusseq von AT reiche Region, daneben GC Bereiche, hier binden TF (TFIID mit TBP)
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| CAAT Box? | liegt im Promoter, Konsensussequenz ist CAAT oder CCAAT, CAAT-Boxen sind Sites, an die Proteine (TFs) an die DNA binden.
◦ Wurden durch Mutationsanalysen ermittelt.
-70-80bp
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| Reihenfolge bei Transk? | CAAT->TFIID hat TBP-> TATAA-> TFIIA->TFIIb-> Pol
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| CpG- Inseln? | Bereiche mit hoher CpG-Dinukleotid-Dichte.
Cytosin-phosphatidyl-Guanosin,0,5kb bis 2kb Länge mit GC-Gehalt von über 60%
60-90% aller CpGs des Genoms von Säugetieren sind methyliert. Gen wird nicht abgelesen
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| CG-Box? | meist wenn TATA-Box fehlt,wird vn TF SP1 erkannt,GC reich 20-50bp,100bp upstream vom Start, häufig mit multiple 5'-Startstellen
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| Was sind TF? Aufgabe? | sie beeinflussen die Transkription positiv oder negativ, wie Aktivatoren und Repressoren.Binden an DNA. Haben 2 Domänen, eine binden an DNA andere Aktivator oder Repressor.
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| Allg TF? | sie binden mit dem Core-Enzym in Promoter.
TFIIA, B, D, E, F, H und TBP. sind wichtig für transk, aber sie regulieren NICHT die Transkription
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| Promoter Elemente in cis? | cis Elemente liegen in definierte Lage: CAAT Box, GC-Box, TATA-Box, Octamer-Box
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| wie wurden Promoter elemente gefunden? | bei einem Gen Basen durch Punktmutation ausgetauscht->an manchen Stellen (Punkte) hohe Transkription an anderen nicht oder gar nicht. An CAAT, CG und TATA boxen-> Reduktion der Transkription
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| was ist Prä-initiationskomplex? | TFIIA, B, D, E, F, H bilden Prä ik
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| TBP | Bindet an TATA-Box, verbiegt die DNA, wird bei Pol II immer benötigt, ist UE von TFIID, binden in der kleine Furche
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| Spezifische TF? | sind nicht in allen Zellen oder zu jeder zeit vorhanden.Binden außerhalb des Promoter Bereich an die DNA.Aktivieren oder hemmen bestimmte Gene, wie Proteine die an Enhancer binden.Egal b sie an DNA binden oder nicht.sie regulieren die Transkription
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| Enhancer? | Reguliert gewebespezifisch Gene, liegen teilweise entfernt vom Gen, können vor oder hinder dem Gen liegen,hier binden viele Proteiene wie Aktivatoren Repressoren, zus bilden sie Enhanseosom. Wirkung erfolgt über die Bindung an die DNA.
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| Enhanseosom | im Enhancer Bereich der DNA kommen viele Proteine zusammen bilden das Enhanseosom, biegen dabei die DNA, damit Enhanser zum Promoter kommt, der aktiviert od repremiert wird
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| S/MARs und Insolatoren? | S/Mars ist die Sequenz, Insolatoren sind die Proteine die dran binden, Insolator Reg ist Struktur konserviert nicht Sequenz, Wirken Richtung unabhängig, können alle Gene in sein Loop kontr.
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| können Enhancer auch runterregulieren? | ja sie heißen dann Sinencer
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| wie wird der Wirkungsbereich des Enhancers begrenzt? | Durch Insulatorregion (boundary Elemente), Die Loopsknoten bilden
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| wie wird die bewegung des Enhandser zum Promoter bewirkt? | Mediatorkomplex, aus ca. 20 UE (Proteine)
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| was ist der Unterschied zw der Proteine des Enhanseosoms und Mediatorkomplexes? | Proteine des Enhansers binden an DNA, des Mediatorkomplexes nicht, können aber kurzzeitig an die DNA binden.
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| interagiert Mediatorkomplex mit Pol II? | ja
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| Locus Kontrollregion LCR? | Unterschiedliche Startpunkt der Transkription wird reguliert bie betaglobin. ist 15000bp Region. LCR liegen viele Tausend Basenpaare vom Transkriptionsstart entfernt und bestehen aus DNase I-sensiblen Regionen
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| was ist der Unterschied zw LCR und Enhancer? | Enhancer Richtung unabhängig, LCR Richtung abhängig
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