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GeneXpress 08
Epigenetik
Question | Answer |
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Epigenetische Effekte (EE) Definition? | EE sind reversible Veränderungen der Genexpression, DNA-Sequenz wird nicht verändert in Ausnahmen vererbbar nicht nach Mendel vererb von Parental auf Tochter mindestens auf eine Generation weitergegeben EE in somatischen Zellen |
EE durch welche Faktoren beweinflusst? | Erziehung, Ernährung, Umwelt, Medizin |
EE molekuare Ursachen? | meist Reguliernenden Proteine auf der DNA DNA Methylierung (CpG- Inseln) Modifikation der Histone Methylierung Acetylierung Remodelling Nicht cdierende RNAs wie piRNAs,siRNA |
Was beeinflussen EE? | Entwicklungsvrgänge Gewebespezifische Genexpression Krankheiten (wie Krebs) |
Nenne EE | X-Chrom.-Inaktiv/ Barr-Körperchen Genomic Imprinting Transvektion Gen-Silencing (→ RNA im Zytoplasma) RDM:Chromatin Silencing durch kleine RNAs |
was ist Paramutaion? | Paramutation ist eine epigenetische Wechselwirkung zwischen zwei Allelen eines Gens, die zu einem Erbgang führt, der nicht mit den Mendelschen Regeln vereinbar ist |
DNA Methyiert aber kein EE? | es kommt auf die Anzahl der Methylierung an, wenn viel Methyliert-> kommt es zu EE |
Warum ist DNA Methy gefährlich? | es können Basen entstehen, die nocht gewollt sind, wie 1.Cytosin->deaminiert->Uracil oder 2.5-Methycytosin->deaminiert->Thymidin bei 1 wird in DNA U als falsche Base erkannt aber nicht bei 2 da T |
CpG-Inseln Methyliert was passiert mit Gen und Phänotyp? | CpG ist in der nähe des Promoters, Wenn methyliert wird das Gen anders abgelesen-> andere Phänotyp, aber die Basenabfolge bleibt gleich |
welche Zellen sind im Laufe der Entwicklung wie Methyliert? | Spermien sind mehr methyliert als Eizellen bei der entw der Keimzellem Methy nimmt zu nach der Befruchtung (frühe Embyo)nimmt ab dann entw der Org nimmt wieder zu |
Warum erkrankte/starb Dolli sehr früh? | Dolli:körperlich so alt wie Mutter, da Mutter somatische Zelle-> kern entfernt andere rein, aber da keine Methylierungsrücksetzungsprozess-> starb frühe |
wie ist die Methyl bei Stammzellen und somatischen Zellen? | Stammzellen sind wenig methyliert, somatisch mehr |
we werden EE Nachgewiesen? | Na-Bisulfit-Kartierung(Detektion Methy DNA) ChIP(Chromatin-Immun-Präzipitation)->Bestimmung von DNA-Protein-Interaktion |
Na-Bisulfit-Kartierung? | Na-bisulfit macht C zu U (Deamin) Methylierte C bleibt erhalten( weil Meth-C->Deamin->T geht nicht die hälfte der DNA behandelt, hälfte nicht PCR-> Pol verbindet meth-C mit G, U wird A dann mit T verbunden.Nun statt CG->TA nicht Methy=TA, Methy=CG |
ChIP? | 1.Chromatin isolieren 2.Crosslinking (Kovalente bindung zw Nucleosm+DNA) 3.Lysieren den Zellkern 4.DNA mit Ultrashall zerkleinern 5.Antiköerper gegen bestimt Histon 6.Fällung dieses modif Histn 7.Trennung diese Histons von DNA 8.DNA sequenzieren |
X-chromosom Inaktivierung /Barr K?Bsp Katze | bei Weiblichen Katzen haben 2 X, Allel für Rot und schwarz liegen auf eine der X,in eine Zelle aber immer nur eine Aktiv, andere in Enbyoentw inaktiviert zufällig |
Genomic Imprinting (genetische Prägung)? | Expression von einem Gen hängt davon ab, ob das von Vater oder Muter kommt, warum? Zusätzliche DNA mod in Keimbahnen,keine Veränd der Basenfolge, nicht nach Mendel vererbar |
Beispiel für Genomic Imprinting? | Tiger(Vater)+Löwe(Mutter)->Tigon normal Löwe(V)+Tigerin(M)-> Liger,langes großes tier |
Prader Willi syndrom<-> Angelman Syndrom | PWS Vater, AS von Mutter, Krankheiten durch Genomic Imprinting, 70% handelt es sich um Delition, endweder Vater oder Mutters deaktiv |
was ist wenn beide Chromosomenbereichen von Mutter kommen? | PWS, weil väterliche Chromosomenbereich fehlt |
Agouti Maus? | Agouti-Gen für Fellfarbe (gleiche Gen) Avy-Locus duch Methy inaktiv-> Braun,schlank und durch wenig der keine Methy aktiv-> gelb und Fett |
Was passiert wenn man non-Agouti mit Avy kreuzt? | Nachkommen mit unnterschied Farbreihe |
Avy Maus gelb Fett schwanger bekommt Vitamine in Schwangerschaft-> | Phönotypische effekt-> Nachkommen braun+schlank, weil Agouti Gen methyliert wird |
Bienenlarven mit Gelee Royal gefüttert | Arbeiterinnen und Königen haben gleiche Gene:Gelee Royal verursacht die Differenzierung von Bienenlarven zu Königen Gellee Royal enthält Methyltransferase-Inhibitor, wenn man mit RNAi diese inhibiert-> differenzieren sich aus Larven Königinen |
Cocain? | Führt zu Acytylierung von histonen, kann auch lange nach Absetzung bestehen bleiben |